Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Opn3Q9WUK7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Opn3Q9WUK7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Opn3Q9WUK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms