Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lhx6Q9R1R0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lhx6Q9R1R0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lhx6Q9R1R0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lhx6Q9R1R0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms