Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ntn3Q9R1A3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ntn3Q9R1A3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntn3Q9R1A3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms