Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0T8

Ikbke, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkeQ9R0T8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkeQ9R0T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkeQ9R0T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkeQ9R0T8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkeQ9R0T8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IkbkeQ9R0T8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IkbkeQ9R0T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IkbkeQ9R0T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkeQ9R0T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms