Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt71Q9R0H5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt71Q9R0H5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt71Q9R0H5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms