Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek3Q9R0A5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek3Q9R0A5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek3Q9R0A5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek3Q9R0A5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms