Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AmfrQ9R049 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AmfrQ9R049 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AmfrQ9R049 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms