Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CtsfQ9R013 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CtsfQ9R013 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CtsfQ9R013 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms