Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1bp2Q9R000 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1bp2Q9R000 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb1bp2Q9R000 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb1bp2Q9R000 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itgb1bp2Q9R000 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itgb1bp2Q9R000 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms