Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp11cQ9QZW0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp11cQ9QZW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms