Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Six6Q9QZ28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Six6Q9QZ28 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Six6Q9QZ28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms