Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clic4Q9QYB1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clic4Q9QYB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clic4Q9QYB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clic4Q9QYB1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms