Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tomm40Q9QYA2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tomm40Q9QYA2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tomm40Q9QYA2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tomm40Q9QYA2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tomm40Q9QYA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 472.4 ms