Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb11Q9QY30 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcb11Q9QY30 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb11Q9QY30 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms