Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpsf3Q9QXK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpsf3Q9QXK7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpsf3Q9QXK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms