Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChmQ9QXG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ChmQ9QXG2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ChmQ9QXG2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChmQ9QXG2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms