Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trp53inp1Q9QXE4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms