Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tcea2Q9QVN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tcea2Q9QVN7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcea2Q9QVN7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms