Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mid2Q9QUS6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mid2Q9QUS6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mid2Q9QUS6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms