Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dkk3Q9QUN9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dkk3Q9QUN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dkk3Q9QUN9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms