Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cln8Q9QUK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cln8Q9QUK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln8Q9QUK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms