Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdkl2Q9QUK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms