Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Edf1Q9JMG1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Edf1Q9JMG1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edf1Q9JMG1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms