Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn15Q9JLG8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capn15Q9JLG8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn15Q9JLG8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn15Q9JLG8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms