Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pkd2l2Q9JLG4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pkd2l2Q9JLG4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms