Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr5Q9JLF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr5Q9JLF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlr5Q9JLF7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr5Q9JLF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms