Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TefQ9JLC6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TefQ9JLC6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TefQ9JLC6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TefQ9JLC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms