Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nectin3Q9JLB9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nectin3Q9JLB9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nectin3Q9JLB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nectin3Q9JLB9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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