Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk3aQ9JKX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upk3aQ9JKX8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk3aQ9JKX8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms