Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AatfQ9JKX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AatfQ9JKX4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AatfQ9JKX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AatfQ9JKX4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms