Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pole3Q9JKP7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms