Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufaf3Q9JKL4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ndufaf3Q9JKL4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ndufaf3Q9JKL4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms