Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap4m1Q9JKC7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap4m1Q9JKC7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap4m1Q9JKC7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap4m1Q9JKC7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms