Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ybx3Q9JKB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ybx3Q9JKB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ybx3Q9JKB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ybx3Q9JKB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ybx3Q9JKB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ybx3Q9JKB3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ybx3Q9JKB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms