Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cacng4Q9JJV4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cacng4Q9JJV4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng4Q9JJV4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms