Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog8Q9JJA2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cog8Q9JJA2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cog8Q9JJA2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cog8Q9JJA2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog8Q9JJA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms