Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA7

Sphk2, Sphingosine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk2Q9JIA7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sphk2Q9JIA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sphk2Q9JIA7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sphk2Q9JIA7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms