Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MkksQ9JI70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MkksQ9JI70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MkksQ9JI70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MkksQ9JI70 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MkksQ9JI70 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms