Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmod3Q9JHJ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod3Q9JHJ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod3Q9JHJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod3Q9JHJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms