Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc40a1Q9JHI9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc40a1Q9JHI9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc40a1Q9JHI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms