Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc13a1Q9JHI4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc13a1Q9JHI4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc13a1Q9JHI4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc13a1Q9JHI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms