Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NckipsdQ9ESJ4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NckipsdQ9ESJ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NckipsdQ9ESJ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms