Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc28a3Q9ERH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms