Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb3Q9ERD7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb3Q9ERD7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb3Q9ERD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb3Q9ERD7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms