Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Tfip11Q9ERA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tfip11Q9ERA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tfip11Q9ERA6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms