Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r44Q9EQ47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r44Q9EQ47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms