Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ropn1lQ9EQ00 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ropn1lQ9EQ00 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ropn1lQ9EQ00 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms