Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SyncQ9EPM5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SyncQ9EPM5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SyncQ9EPM5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms