Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eif3fQ9DCH4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3fQ9DCH4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3fQ9DCH4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms