Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrotQ9DC50 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CrotQ9DC50 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CrotQ9DC50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms